Séminaire de Probabilités et Statistique :

Le 20 juin 2016 à 15:00 - UM - Bât 09 - Salle de conférence (1er étage)

Présentée par Journot Laurent - Institut de Génomique Fonctionnelle, CNRS

Biologie systémique des gènes soumis à empreinte génomique parentale

L'empreinte génomique parentale est un mécanisme épigénétique de régulation génique qui aboutit à l'expression mono-allélique d'environ 150 gènes chez les mammifères; l'allèle exprimé est alors choisi en fonction de son origine parentale, maternelle ou paternelle. Les gènes ciblés par l'empreinte génomique au cours de l'évolution semblent fonctionnellement disparates. Nous essaierons de montrer qu'ils appartiennent cependant à un unique réseau de gènes corégulés transcriptionnellement qui contrôlent un même processus biologique. L'identification de ces gènes soulève plusieurs problèmes statistiques et, dans le cadre de cette étude, nous présenterons ISoLDE, une nouvelle méthode non paramétrique permettant d'identifier les gènes présentant un biais significatif d'expression allélique, quelle que soit l'origine de ce biais.