Séminaire de Probabilités et Statistique :

Le 27 janvier 2020 à 13:45 - SupAgro bât 9 Salle 208

Présentée par Fritsch Coralie - Inria Nancy Lorraine

Modélisation spatio-temporelle de la chalarose(maladie fongique du frêne)

La chalarose est une maladie du frêne apparue en Pologne en 1992 et observée pour la première fois en France en 2008. La maladie est causée par un champignon pathogène qui se développe sur les rachis infectés tombés aux pieds des arbres durant l?automne. Les champignons libèrent des spores qui se dispersent durant l?été et infectent ainsi les arbres voisins provoquant la propagation de la maladie. Depuis 2008, environ 500 sites de forêt sont visités chaque année et nous disposons de la proportion d?arbres infectés parmi ceux inspectés pour chaque visite. Basé sur nos connaissances sur le cycle de la maladie et afin de mieux comprendre la propagation de la maladie en France dans les prochaines années, nous avons développé un modèle mécaniste spatio-temporel décrivant la propagation de la maladie. Ce modèle est basé sur un modèle paramétrique latent représentant l?infection des rachis et tenant compte des effets de l?humidité et de la température ainsi que d?un modèle de réaction-diffusion décrivant la propagation des spores. Pour l?inférence des paramètres, uniquement basée sur la proportion d?arbres infectés, nous avons utilisé une approche Bayésienne et des simulations MCMC.Travail en collaboration avec Anne Gégout-Petit (IECL & Inria), Benoît Marçais (INRA) et Marie Grosdidier(INRA).