Séminaire ACSIOM :

Le 11 janvier 2022 à 13.15 - distanciel

Présentée par Lavigne Florian -

Modélisation de l'adaptation d'un pathogène dans un environnement variable et sous l'effet de mutations anisotropes

L'évolution d'une population asexuée (comme des virus, des bactéries, ou des cellules cancéreuses) dépend de plusieurs facteurs externes (e.g. la concentration d'antibiotiques). A l'aide des mutations et de la sélection, ces pathogènes peuvent résister à de tels changements environnementaux, ce qui impose de bien comprendre l'impact de ces changements sur l'adaptation de tels individus. Pour ce faire, un modèle basé sur des EDP non locales permet de décrire la dynamique d'une telle population structurée en phénotypes, dans un environnement variable. La description asymptotique de ce modèle a déjà été développée avec certains types de variations (linéaires, périodiques). Une nouvelle approche a été développée récemment, en considérant une forme très générale pour la variation environnementale, et donnant une description temporelle de l'adaptation. Cette étude a été limitée dans le cadre d'une variation selon une direction donnée, et des mutations isotropes. Cependant, de récentes recherches ont montré que les mutations anisotropes peuvent modifier la dynamique adaptative de la population : quand les variances directionnelles des mutations ont différentes échelles, certains plateaux évolutifs peuvent apparaître, permettant de décrire de récentes données évolutives (e.g., celles de Long Term Evolutionary Experiment). C'est pourquoi nous allons nous intéresser à regrouper les deux hypothèses - variation de l'environnement (sans aucune direction précise) et anisotropie mutationnelle - dans cette présentation. La méthode se basera sur l'étude de la distribution multivariée d'un vecteur de composantes de "fitness" à (2n) coordonnées, solution d'une équation parabolique dégénérée, et dont la fonction génératrice vérifie une équation différentielle résoluble.

L'exposé se fera via zoom:

https://umontpellier-fr.zoom.us/j/91711231570?pwd=cVdXUEtNSnFXZG1XYjhoYjNMR3JBdz09