KeOps: operations dans les espaces à noyaux, sur GPU, avec différentiation automatique, sans dépassement de mémoire


  • KeOps : Bibliothèque en C/C++/Cuda avec des "bindings" en python, matlab et R pour faire des opérations génériques de réduction (typiquement utilisées par les méthodes dîtes à noyaux) à l'aide d'un GPU. Le code Cuda est particulièrement efficace car il utilise une implémentation dite 'par dalle' permettant de conserver un stockage en \(O(n)\) (contrairement aux bibliothèques standards type Thrust qui stockent de l'ordre de \(O(n^2)\) éléments).

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Deformetrica: analyse statistique de formes 2d et 3d


  • Deformetrica : Logiciel très complet pour le traitement statistique de formes (courbes, surfaces, images,...) et de données longitudinales. Il est actuellement développé par l'équipe Aramis (INRIA) et est codé en python.

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Fshapes Toolkit: estimation d'atlas de formes fonctionelles (fshapes)


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    Fshapes Toolkit : Boîte à outils codé en Matlab, C et Cuda pour le traitement de formes fonctionelles (ensembles de points, courbes ou surfaces accompagnées d'un champ scalaire). Voici une vidéo illustrant une estimation d'atlas pour les données OCT avec une pénalité H1 sur le signal :

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Implicit modules: déformations non rigides via des contraintes implicites