Séminaire de Probabilités et Statistique
lundi 04 janvier 2010 à 14:30 - UM2 - salle 331, bâtiment 9 (math)
Sébastien Li Thiao-Té (AgroParisTech)
Estimation du nombre d'espèces non observées en métagénomique
En métagénomique, on réalise le séquençage haut-débit de populations microbiennes sans mise en culture des micro-organismes. Cette approche a révélé un grand nombre d'espèces inconnues dans le sol, l'eau de mer et la flore intestinale. On souhaite estimer la diversité du milieu étudié au travers du nombre d'espèces microbiennes présentes, et de leurs abondances respectives. Cependant, les données sont tronquées car la majorité des espèces n'est pas observée. Nous présenterons des modèles de mélange pour l'estimation du nombre d'espèces et la modélisation de leur distribution.